Conflux sử dụng cơ chế đồng thuận lai PoW+PoS để chống lại các cuộc tấn công, cấu trúc Tree-Graph để loại bỏ lãng phí do phân nhánh, thuật toán GHAST để ngăn chặn phân nhánh độc hại, và cơ chế khuyến khích động để giảm khai thác ích kỷ, qua đó xây dựng một hệ thống an ninh hoàn chỉnh từ lớp đồng thuận nền tảng đến lớp ứng dụng. Đồng thời vẫn duy trì hiệu năng cao, Conflux đạt mức độ an toàn phi tập trung tương đương với Bitcoin và Ethereum.