Betreiber von BTCPay Server, die die standardmäßige Docker-Bereitstellung nutzen, müssen bei der nächsten Einrichtung oder Aktualisierung Tor ausdrücklich auswählen, um weiterhin Zugriff auf Onion-Dienste zu haben. Laut NS3.AI ist Tor nicht mehr automatisch enthalten, wird aber weiterhin unterstützt, und vorhandene Daten bleiben in den aktuellen Tor-Volumes erhalten.

Version 2.4.5 blockiert standardmäßig außerdem Ziele in privaten Netzwerken für bestimmte ausgehende HTTP-Anfragen, um das Risiko von Server-Side Request Forgery zu verringern. Betreiber, die bewusst private Dienste nutzen, müssen die erforderlichen Ziele zulassen.